巴彦淖尔市林业科学研究所建于1973年10月。下设：科研管理室、造林技术研究室、种苗研究室、经济林研究室、试验场和行政办公室。全所有科学实验基地220亩，内设化验室、情报资料室、档案管理室和标本室，科研设备比较完善，技术力量比较雄厚。

　　主要职责任务：负责巴市地区盐碱、风沙、干旱等自然灾害的治理与研究；农田防护林丰产更新改革技术的研究以及造林技术的推广应用；半荒漠地区天然植被更新复壮；沙漠开发利用的研究以及苗木的引种选优和丰产技术的研究；新树种引种驯化与选优。

　　建所以来，立足于地区林业发展实际，围绕巴市域内的乌兰布和沙漠、河套平原、乌拉特高平原及山地丘陵区，开展了广泛的林业研究试验。以西部大开发，林业生态建设重点工程的启动为契机，采取多种形式，主动适应科学技术和经济建设的发展需要，积极探索林业生产的客观规律，把科研、生产、推广有机结合起来，充分发挥自身优势，不断强化内部管理，实行“以科研育人才、以生产促发展、以推广求效益、以实力争地位”的指导思想。经过多年的探索奋斗，在人才培养和林业科学研究方面取得了一定的成绩，为解决巴市地区林业建设中的技术难点和疑点发挥了重要作用。特别是近几年，配合天保工程的全面启动，针对巴市林业生产中存在的问题，面向林业重点工程，积极开展了多项科研攻关项目，引进林业新技术、新方法、新材料，建立林业科技示范区，为林业生态工程提供技术样板和科技支撑。开展了新树种的引种、驯化与推广工作；开展了《集水抗旱造林技术研究》、《黄柳（沙柳）再生生物沙障营造技术研究》、《梭梭接种肉苁蓉技术研究》；建设了乌拉特中旗退耕还林（草）科技示范园、杭锦后旗农田防护林科科技范围；承担了乌拉特中旗退耕还林（草）工程、乌北林带建设工程、山前农防林科技示范点建设、天牛隔离带建设和牧区草库仑建设的技术指导工作。定期出版《巴彦淖尔市林业科技》，与内蒙古自治区林业科研院所及大专院校密切合作关系，技术外延大，科研成绩显著。